Pigmentet melanin är den viktigaste faktorn för ögonens färg. Ju mer melanin, desto mörkare blir ögonen.
Små mängder melanin i ögats iris, regnbågshinnan, får ögonen att se blå ut.
Färgen finns faktiskt inte i själva ögonen. Vi uppfattar ögonen som blå på grund av det sätt ljuset sprids och reflekteras i luften.
Detta fenomen är besläktat med det sätt på vilket solens ljus sprids av molekyler i atmosfären, så att himlen får sin blå färg.